孕酮低一般见于黄体功能不足的女性，引起黄体功能不足的原因有垂体分泌的黄体生成素、促卵泡刺激素不足或者分泌泌乳素过多等引起，另外熬夜、过度节食、压力大、环境改变、口服避孕药及精神药品都可能导致黄体功能不足。
由于黄体分泌功能不足，从而导致孕酮低，子宫内膜分泌转化不足，容易导致子宫异常出血、受精卵不易着床或者不孕及习惯性流产等。
临床主要表现在月经周期缩短、不孕及先兆流产等，一般在排卵后可以通过查血孕激素来判断，治疗可以通过孕激素制剂来补充，一般选择天然孕激素治疗。