脑疝时行腰穿会加重脑疝的症状及进展，并危及生命。患者发生脑疝时颅内压力明显增高，引起脑组织明显移位，进而引起神经功能的不同损伤，产生严重的症状，出现不同类型的脑疝。
腰椎穿刺释放脑脊液，尤其是放液过快时，椎管内压力会过低，使其与颅腔之间形成了明显的压力差，会导致颅腔内脑组织移位更加明显，对颅内重要结构压迫更加明显，尤其会加重枕骨大孔疝，导致患者呼吸骤停发生。
因此脑疝时不能行腰椎穿刺，可给予脱水利尿药物应用降低颅内压力。