发生骨髓增生异常综合征的时候，由于骨髓当中存在着粒系、红系以及巨核细胞的病态造血、无效造血，外周血当中可以出现全血细胞的减少，从而有可能会出现相应的症状。
红细胞减少的时候，病人有可能会出现贫血的症状，可以有疲倦、乏力、头晕、头痛、耳鸣、活动后心悸、气短等。
白细胞减少的时候，病人有可能会容易出现感染，可以有上呼吸道的感染，比如可以有咳嗽、咳痰，也有可能会出现泌尿系统的感染，比如可以有尿频、尿急、尿痛等。
如果是病人出现血小板减少，还有可能会出现全身多个部位的出血症状，另外骨髓增生异常综合征的患者，还有可能会出现肝、脾、淋巴结的肿大。