阴道纵隔是可以做试管婴儿的，这种纵隔来自于阴道的，对胚胎移植影响很小，但如果同时合并宫颈或子宫纵隔，应该在移植前给予治疗。
如果不治疗胚胎即使可以顺利进行移植，也是会造成分娩困难，而且如果是双子宫很可能会出现移植失败，如果患者的阴道纵隔是不完性的纵隔，这样在分娩的时候就可能会出现分娩受阻，这样就需要根据患者的情况，在医生指导下选择是否需要进行阴道纵隔切除术。
所以，一旦发现阴道纵隔要选择正规医院，规范化治疗，这样才能有效提高试管移植的成功率。