在临床上功能性不射精症的病因很复杂，临床可分为继发性、选择性、偶发性三种。
一、继发性不射精症，婚后曾有过正常的射精，但是由于精神创伤或者是心理的一些疾病而失去的射精能力，如性无知、性交方法不当或长期手淫，不正当的性交被他人发现后受到责备等可以形成病态心理，以致于正常的性交反而失去射精能力。
二、选择性不射精症，这类患者表现为性交时不射精，而在手淫或女方以手绘于其他非性交方式刺激时，可以射精。
三、偶发性不射精症，这里患者发病的病因多为性交过度频繁所致。由于过度频繁的性交不仅排尽了储备的经验，而且使射精中枢由过度的兴奋转而抑制，导致不射精症。