孕酮低有可能会影响到胎儿的发育，但也不是绝对。孕酮是体内支持胎儿正常发育的一种孕激素，在孕早期胎盘还没有发育完全，不足以分泌过多的孕激素时，只能依靠孕酮来支持胎儿的发育，此时如果孕酮偏低极易造成流产。
随着胎盘发育逐渐完善，可以分泌足够的孕激素支持胎儿发育后，孕酮的作用就会逐渐的减弱。如果孕早期出现明显的腹部疼痛或者其它先兆流产症状时，需要及时检查体内孕酮值。
如果发现偏低要及时的补充，以免造成流产。补充孕酮常见的是通过口服、肌肉注射及静脉输液黄体酮来补充。随着孕期的推进和胎盘不断的发育，可以减缓对孕酮的补充。