如果阴茎上起红疙瘩为感染因素所引起，比如包皮龟头炎。在确诊以后主要是进行抗感染治疗，可通过外涂红霉素软膏予以调理，并且也要注意龟头与包皮内部的卫生。
如果真菌感染所引起，主要是通过使用氟康唑软膏等药物进行治疗，在经过1~2周的治疗后通常可治愈。如果阴茎上只是小粉瘤，没有引起其他任何异常症状，可能是局部的皮脂腺分泌旺盛所引起，一般不需要特殊治疗，只需要注意生理卫生即可。
如果阴茎上红疙瘩为过敏因素所导致，在确诊以后，主要是通过使用抗过敏的药物予以治疗。