脑干梗塞是因为供应脑干的血管出现狭窄和堵塞引起的，脑干梗塞主要就是进行保守治疗，主要的方法是通过药物治疗以及后期的康复治疗。
首先，可以用一些抗凝的药物，比如阿司匹林，另外可以通过静脉输液应用一些消肿脱水药物，比如甘露醇。同时用一些营养神经药物，比如神经节苷脂。此外，需要用一些改善脑循环药物，比如丹参多酚盐、天麻注射液等。这样能够促进改善和恢复。
在经过治疗以后，如果后期稳定，可以进行康复治疗。如果存在肢体活动不灵、瘫痪的话，可以做针灸治疗以及高压氧治疗。同时加强功能锻炼，促进恢复和减少后遗症，平时还要注意饮食，不能吃油腻的食物，以清淡饮食为主，预防复发。