指甲有横纹和凹陷可以有以下方面的原因：
1.一些常见皮肤疾病的伴随症状。如慢性湿疹、扁平苔藓或者银屑病，可以伴有指甲横纹或者凹陷。
2.慢性甲营养不良。维生素或者微量元素缺乏，也可以引起指甲改变，导致指甲有横纹或者凹陷。
3.真菌感染。真菌感染指甲引起甲癣，可以出现指甲的改变，导致指甲有横纹或凹陷。部分还可以引起甲面的损毁或者脱屑，可以通过真菌镜检明确诊断。
4.外伤。无论是挤压伤或者重物砸伤，损伤指甲的甲床，也可以引起指甲外形发生改变，出现横纹或者凹陷。