肛门肿痛，很多情况下都是因肛周脓肿导致的，吃阿莫西林可起到一定的消炎，抗感染作用。
肛周脓肿可能是由很多种细菌导致的，阿莫西林只对革兰式阴性杆菌有用，对别的细菌治疗效果很差，甚至是没有效果。所以最好先使用一些抗菌谱广泛的药物进行治疗，而且还要取感染的肛隐窝处的分泌物送细菌培养，及进行药物敏感实验。待结果出来之后，再根据药物敏感实验选用敏感的抗生素。
有时口服药物治疗肛周脓肿的效果并不好，感染会在短时间内成脓，就需要到医院行手术治疗。