治疗肛周脓肿的药物主要有以下几类：
首先，抗生素药物为主。由于该病变是一种感染性病变，常见致病菌为大肠埃希菌。所以一定要选用敏感性抗生素药物抗炎治疗，争取控制和稳定炎症。
其次，由于病变影响会导致患者出现高热、寒战等症状，在使用抗生素药物治疗的同时，可以选择镇痛药物，主要以非甾体抗炎药为主，有较好的解热镇痛功效，帮助患者改善症状。
最后，大多数肛周脓肿需要手术治疗，手术后需要敞开创面。所以，可以局部使用痔疮膏等药物，能够帮助患者改善局部疼痛、瘙痒症状。