鳞状细胞癌的原因有很多，比如，如果机体免疫力长期处于一种低下的状态，就有可能会发生鳞状细胞癌。如果体内被某些病毒侵犯，比如人乳头状病毒、肝炎病毒以及EB病毒，这些都有可能会引起鳞状细胞癌的发生。
还有固定部位的溃疡，长期治疗不能愈合，以及烧伤后的局部疤痕挛缩，还有长期在太阳下晒伤，以及接触有毒有害的药物，毒物和和放射元素，也会导致鳞状细胞癌的发生。
还有长期服用免疫抑制剂的人群，产生粘膜的白斑病，都有可能属于磷状细胞癌的范畴，而且也与种族有一定关系。白种人的发病率又远高于非白种人群，将近50倍。