扁平疣是否需要打针治疗是依据扁平疣的严重程度，以及患者自身的免疫力决定。
如果扁平疣的皮损比较少，组织比较大，可以选择使用一些重组人干扰素在局部封闭注射，这种情况可以加快扁平疣的消退。如果患者的免疫力较低，造成扁平疣生长的速度较快，可以选择卡介菌多糖核酸进行肌肉注射，这些方式都属于打针的治疗手段。
如果扁平疣长得比较多，而患者的免疫力相对又比较强的情况下，则可以不进行打针治疗。可以选择使用液氮冷冻或者是激光去除，还可以配合一些外用的重组人干扰素凝胶进行治疗。