骨神经纤维瘤可能有后遗症。
如果患者没能重视及早发现、及早治疗，或者是没能进行正规治疗。随着病情逐步进展，可能会遗留脊柱侧凸、足下垂、肢体过度肥大等后遗症。而且该病具有一定的恶变概率，部分病情比较严重的患者可能会由骨神经纤维瘤转变为纤维肉瘤。
因此，一旦发现并确诊骨神经纤维瘤，应根据患者的病情程度及早进行手术治疗。将肿瘤彻底切除，达到根治的目的。多数患者经过规范化的手术治疗，预后较好。