肛门化脓有可能会引发脓毒症。
肛门化脓局部会形成脓肿，脓腔压力高，细菌就有可能会入血而引发全身性的感染，患者会伴有发热、畏寒、寒战等全身症状。严重的就有可能会导致脓毒症，甚至是感染性休克。特别是对于一些患有导致机体免疫力低下疾病的患者，例如患者患有糖尿病、血液系统疾病，以及年老体弱的患者，其肛门化脓引发脓毒症的概率会有所提高。
当患者肛门化脓引发脓毒症时，在积极通过手术切开引流治疗原发疾病的同时，还需要积极使用广谱抗生素控制全身的感染，以免导致患者出现感染性休克。