感染尼帕病毒可以出现胃痛、反酸症状，但并非特异性体征。尼帕病毒感染导致胃痛、反酸常见于两方面因素：
首先，尼帕病毒感染可以侵袭血管组织，如果胃黏膜血管组织被尼帕病毒感染，可以直接导致胃黏膜损伤，从而出现胃痛、反酸等临床表现。
其次，尼帕病毒感染通常容易合并脑炎、肺炎等重症感染情况。患者身体会处于急性应激的状态，胃肠道会相对缺血，从而诱发应激性溃疡，表现在胃部，可以因胃黏膜溃疡而出现胃痛、反酸症状，同时可伴有呕血或黑便。