慢阻肺与以下疾病鉴别：
哮喘、慢阻肺为中老年发病，症状缓慢进展，多有长期吸烟，哮喘多为儿童或青少年期起病，症状起伏大，常伴有过敏史，鼻炎等，肺功能气流受限有显著的可逆性，合理吸入糖皮质激素等药物常能有效控制病情，是与慢阻肺鉴别的重要特征。但是部分病程长的哮喘病人可发生气道重塑，气流受限的可逆性减少，两者的鉴别诊断比较困难，此时应根据临床及实验室所在，全面分析进行鉴别，在少数病人中，这两种疾病可以重叠存在。
其他引起慢性咳嗽，咳痰症状的疾病如支气管扩张，x线检查囊状支气管扩张的气道表现为显著的囊腔，腔内可存在气液平面，可以出现双轨征、环形阴影的特殊表现，肺部高分辨率ct，可以进行鉴别。
肺结核除咳嗽咳痰等症状外，还有潮热、食欲下降等全身结核中毒症状，x线胸片或者肺部ct可以鉴别。
肺癌胸片或胸部ct可有肿块，特发性肺纤维化，胸片和高分辨率ct上可见磨玻璃样改变。
另外还需要与冠心病、高血压性心脏病、心脏瓣膜疾病等进行鉴别。