因为脑干是整个大脑的中枢司令部，管理人的心跳、呼吸、血压以及很多内分泌系统，所以在脑干部位如果出现占位性病变，患者会出现饮水呛咳、言语含糊、头晕、肢体活动障碍，甚至意识不清，严重的可以出现心率异常、血压下降等。
脑干部位的肿瘤，手术难度相对比较大，不过只要病变局限、部位表浅、临床体征呈进行性加重，可以考虑进行手术。
如果肿瘤呈浸润性生长，范围较为广泛，则不宜进行手术治疗，否则有可能导致患者昏迷，严重时引起死亡，还可以根据患者的具体情况选择放射治疗及化疗。