小儿腓骨肌萎缩症能进行手术，主要是针对于存在足踝畸形或者是严重功能障碍的患者。一般是进行外科矫正手术，比如三关节融合手术，由于左肢和右肢都会发病，应当左右侧的肢体分期进行手术，不可一并进行手术。
在术后恢复的过程当中，患儿也要进行康复治疗，比如适当地进行伸膝或者是髋外展的活动，能够防止肌肉萎缩以及维持肌力。
在日常患者也要做好防护措施，尤其不要出现外伤，如果出现了伤口，应当及时地进行消毒，患儿也不要有过大的心理压力。