房间隔缺损手术大概需要半个小时到一个小时，由于所选择的手术方法是不一样的，所以时间方面也会存在一点差异。
房间隔缺损手术主要是通过介入手术和开胸手术治疗两种方法。介入手术利用的是房间隔缺损封堵术治疗，主要适合于大小合适的房间隔缺失人群，手术创伤性是比较小的，属于一种微创手术，而且时间也比较短，大概半个小时就可以完成。
开胸手术主要适合于房间隔缺损比较严重的人群，是通过房间隔缺损修补术治疗，大概需要一个小时才可以完成。