双肾结石对肾功的影响，取决于结石大小以及对泌尿道梗阻的严重情况。
双肾虽然有结石，但是测值较小不会导致结石嵌顿而严重肾积水，对肾功不会造成影响。通过增加饮水、体外震波碎石等处理后，细小结石可自行排出。
超声检查提示双肾有较大结石，影响正常排尿，导致重度肾积水，可对肾功造成影响。需要结合超声定位、测量结石径线值，评估结石质地坚硬度，可考虑碎石，或者是手术切开取石处理。结石有效排除，解除泌尿道梗阻，可有效预防双肾结石影响肾功。