婴儿地中海贫血如果为轻型、静止型，一般不需要治疗。如果为重型，可以输血、去铁稳定病情，或者进行造血干细胞移植。
1.输血、去铁治疗。地中海贫血为珠蛋白生成障碍性贫血，导致婴儿体内贫血与铁过载情况并存。如果出现严重贫血或者溶血危象，需要进行输血、去铁治疗，去铁可服用去铁胺，或者地拉罗司等铁螯合剂。同时婴儿可服用叶酸片或者维生素B2，刺激维生素B6的代谢，缓解贫血症状。
2.造血干细胞移植。为重型地中海贫血的唯一根治方式，一般需要与婴儿血型适应的供体提供造血干细胞，因为国内供体缺少，且配型困难，多为父母自身作为供体移植。