非淋菌性尿道炎的危害如下：
1.非淋菌性尿道炎通常会引起比较严重的排尿疼痛，以及排尿频繁等症状，会给患者带来比较大的痛苦。尤其是在夜间发作时会导致患者失眠，从而严重影响到患者的生活与工作。
2.在患有非淋菌性尿道炎后，由于患者担心会将致病菌传染给配偶，可能会使患者出现心理障碍，也会影响到夫妻的感情。
3.非淋菌性尿道炎会使男性患者出现附睾炎、前列腺炎等生殖系统疾病，会影响到男性的生育能力，会使女性出现输卵管炎、子宫内膜炎等，降低女性的受孕能力。