咳嗽时伴有明显臭味，可能与细菌或真菌感染有关。肺部在处于明显的感染情况下，有可能会出现咳嗽伴有臭味。
另外，还有一部分肺脓肿，除咳嗽以外还会伴随咳痰现象，痰液中也会出现腥臭味。如果口腔清洁护理不到位，加上长期吸烟，很有可能会引起口腔疾病，比如牙结石。咳嗽的同时也会将口腔当中的臭味呼出，通常清洁口腔之后症状便会有所改善。
若同时伴有胸痛、咳血、消瘦等，咳嗽期间伴随腥臭味，也不排除与恶性肿瘤有关。