输尿管炎一般是由其它疾病引发的，而对于其他疾病的治疗，有些是需要手术的，比如输尿管结石。输尿管结石可以引起结石上方的输尿管以及肾脏积水。如果长期积水，尿液会发生感染，从而引起输尿管炎的形成。在治疗上要取出结石，解除梗阻，保护肾功能，只有这样才能从根本上治疗输尿管炎。
一般情况下，原发性的输尿管炎少见，主要是因为逆行感染所致。比如膀胱炎引起输尿管炎。在治疗上主要是应用敏感的抗生素治疗，也可以联合应用手术治疗是无效的。