对于患有桥本氏甲状腺功能减退的患者，在进行治疗时需要先明确病因，针对病因进行治疗。
对于桥本氏甲状腺功能减退的患者，一般需要选用抗甲减的药物进行治疗。目前常用的药物为左甲状腺素钠片，一般效果比较好，但需要长期服用药物才能够改善症状。
桥本氏甲状腺炎与自身免疫反应有一定关系，而且属于一种慢性炎症。患有桥本氏甲状腺功能减退的患者，不能够盲目进行治疗，可能会出现永久性的甲减，而且也不能彻底治愈，需要终身补充甲状腺素，也需要终身监测甲状腺功能。