鸡眼和跖疣在病因、表现、治疗以及预防上均存在一定区别。鸡眼是一种因为局部受到物理摩擦而造成的疾病；而跖疣是一种病毒感染，有可能跟人乳头瘤病毒感染有关系。
从临床表现，尽管鸡眼以及跖疣都是黄色的，不过鸡眼的表面比较光滑，比较好发于脚趾的边缘；而跖疣比较好发于脚底以及手部。
从治疗上，鸡眼是需要及早治疗，首选的药物就是外用鸡眼贴；而跖疣有一定自愈倾向，大多数跖疣两年内就可以自然消退，一般首选液氮冷冻治疗。