子宫内膜很薄是会影响怀孕的。太薄的子宫内膜不利于受精卵的着床，也不能提供受精卵需要的营养，会导致胚胎发育不良、胚胎停育以及流产。
实际上避孕药也是通过抑制子宫内膜的生长，破坏宫腔的子宫内膜环境，起到避孕的作用。因为精子与卵子结合之后会形成受精卵，一般受精后7~9天就会在子宫内着床。如果这个时候子宫内膜还没有长到合适的厚度，往往会导致着床失败。
一般在排卵期，子宫内膜至少要达到7mm以上才是比较好的。如果子宫内膜过薄，往往需要补充雌激素来促进子宫内膜的生长，这样才有利于怀孕，太薄的子宫内膜是会明显地影响怀孕的。