大多数未分化结缔组织病不能治好，这个疾病是一种慢性病，不能被治愈，但有些轻症患者在早期积极治疗后，患者的症状可以完全消失，只服用极少的药物维持治疗，甚至可以停用药物，但是在整个病程中，无论是否服用药物治疗，患者都需要定期到门诊随诊，监测是否有病情复发或者是出现新的病情活动。
未分化结缔组织病可能是一个独立的疾病，也可能是某个具体结缔组织病的前期阶段，有些未分化结缔组织病随着病程的进展，可以转化为具体的疾病，比如系统性红斑狼疮，干燥综合症，混合性结缔组织病，多发性肌炎，或者类风湿关节炎等。未分化结缔组织病也可能持续患者的终身，并不转化为某一个具体的疾病，大多数未分化结缔组织病只累及到关节，肌肉以及浆膜腔积液等表皮，很少累及到内脏。