导致月经不干净的主要原因有：
1.功血。见于月经淋漓不尽或者月经量多、经期延长，伴有头晕、脸色苍白等症状。青春期女性可以预防感染、止血对症治疗。已婚女性不能排除子宫内膜的病变，首选处理方案是做宫腔镜探查。
2.子宫肌瘤引起月经不干净。见于月经量多，延长10多天，伴有小便多，根据做B超后可以确诊。
3.黄体功能不足引起。见于月经周期缩短，经量不多，容易引起女性不孕或者流产，建议对症治疗。
4.上环引起月经不干净。见于经期延长，但是到第五六天时经量不多，有时随着上厕所时流出一点。