经肛门灌肠一般用于治疗便秘，方法有：开塞露灌肠、温开水灌肠、肥皂水灌肠、甘油或甘油水混合物灌肠、高渗盐水灌肠等。对于较轻的患者或偶尔发病的，可用开塞露灌肠。
温开水灌肠就是用普通的饮用水，因为温开水对肠粘膜的刺激性小。肥皂水灌肠是利用其润滑作用，使其大便顺利排出。甘油及甘油水混合液灌肠在医院里应用最广。
当肠道内大便干结质硬时，其它方法都不能使大便排出，用甘油灌肠效果最好。高渗盐水灌肠可以起到，增加肠内容积物的作用，增加渗透压、润滑大便、软化大便的作用。双氧水灌肠对粪石效果比较好，能松解和软化大便。