导致患者早上眼睛肿胀的病因比较多，需要根据其它的临床症状进行判断。
如果眼睛肿胀期间伴随有眼睑发红、疼痛或者分泌物增多等临床表现，首先考虑炎症性疾病的可能性较大。可以考虑结膜炎、角膜炎等疾病，按照中医，属于肝火旺的表现。需要使用抗生素类的滴眼液，配合清肝火的中成药进行治疗。
如果患者反复出现眼睛肿胀的情况，伴随有小便不适、腰酸、腰痛等临床表现，不排除属于肾性水肿的表现，可能和肾炎等疾病有关。
建议早上空腹去正规医院的泌尿科就诊，需要进行肾脏彩超、肾功能、血尿常规等检查，请根据检查结果咨询主治医生的建议。