睡醒后短暂失忆，原因有以下几种：
1.短暂性脑缺血发作。本病是在脑血管疾病基础上，突然发生大脑缺血、缺氧，会出现相应的神经功能缺损的症状，有时会伴有失忆。一般持续1小时之内会自行缓解，不遗留有神经系统的后遗症。主要通过CT或核磁共振检查、血管超声检查等辅助诊断。
2.癫痫发作。当复杂性癫痫发作或癫痫大发作时候，会伴有意识障碍，可能会有肢体强直痉挛、恶心、呕吐、意识障碍等，可通过脑电图、核磁共振等检查确诊。