中东呼吸综合征会引起肺炎。而且中东呼吸综合征大多数以病毒性肺炎为主要表现形式，患者的影像学可以提示肺部存在感染。疾病进一步发展可以导致细菌性肺炎的发生，最终增加患者的死亡风险。
但是也有一部分患者无任何临床症状，或仅有轻度的呼吸系统症状，同时也可以表现为无肺炎的表现。患者可以出现腹泻等一系列的消化道症状，所以也要进行鉴别。
在中东呼吸综合征疫情期间，可以通过病毒核酸，以及病人的病史、临床症状等方面做出鉴别。不要因为没有肺炎症状就将疾病遗漏。