宝宝发烧头疼可能是脑炎导致的，但不能通过这一症状进行诊断。小儿脑炎的常见症状包括流鼻涕、流眼泪、持续性高烧，较为严重的患者，还可能出现动作不协调、意识模糊、惊厥以及行为异常等现象。
若宝宝为单纯的发烧头疼，并且体温在38.5℃以下，则可能是感冒导致的，可以通过物理降温以及服用感冒药的方式进行治疗。
而宝宝持续性发烧，且体温在39℃以上时，则可能是脑炎，需要尽快将宝宝送到医院进行治疗，以免损伤宝宝的大脑神经，使宝宝的正常生长发育受到严重影响，有的还会留下后遗症。