首先胆汁反流性胃炎一定是有胃炎存在，所以在治疗上首先应用抑制胃酸的药物。抑制胃酸的药物有很多临床上有质子泵抑制剂、h2受体阻滞剂，其中质子泵抑制剂效果更好。可以选择埃索美拉唑、泮托拉唑，或者雷贝拉唑除了质子泵抑制剂以外。
在添加胃黏膜的保护剂，例如麦滋林旅美家胆汁反流，还要应用动力药物例如，伊托必利片这种胃肠动力药物效果更好。如果胆汁反流严重，还可以加用熊去氧胆酸改善胆汁代谢。当然胆汁反流性胃炎，除了吃这么多药物以外，饮食上也要注意清淡。