颅底陷入症主要是以枕骨大孔为中心的颅底骨组织及上颈椎骨质发生畸形。临床表现上以枕骨大孔向颅内陷入，形成短斜坡，齿状突向上移位并进入枕骨大孔内，枕骨大孔前后径变短，颅后窝变小。对于该病的治疗，其原则为：如果患者有神经系统症状和体征。
其次，病情如果呈进行性发展，就需要考虑进行手术治疗。手术治疗的目的主要是颅后窝和上颈椎椎管减压，解除神经组织受压和脑脊液通路受阻，同时需要去除压迫神经组织的异常骨质，稳定颅颈关节。