引起包皮癌的原因一般包括包茎或包皮过长、包皮垢、天生的发育异常等，正常男子的阴茎皮肤较薄，近阴茎头部的皮肤向内反折成双层，覆盖在阴茎上，称为包皮。
婴儿的包皮和阴茎头部稍有粘连现象，1岁左右包皮和阴茎头便自然分开，如果到了青春期，阴茎头仍迟迟不肯显露，就须注意包皮过长可能引起包皮癌。
由于包茎或包皮过长时包皮不能向上翻起，包皮的皮脂腺也会分泌皮脂，皮脂便积聚在包皮的内面与阴茎头之间的间隙中，变成了包皮垢，是包皮癌的发病原因之一。