细菌性肝脓肿多先有原发病的表现，起源于血行者，可有疖肿、软组织化脓、痔感染、阑尾炎、门静脉炎、肠道感染、肺炎、上呼吸道感染、败血症等先驱病变。
起源于胆道病变者可先有胆管结石狭窄，蛔虫钻入等先驱病变。细菌性肝脓肿一般表现为突然出现寒颤高热，多为最早的症状，也是最突出的症状，体温可达39~40℃，热型多为弛张热，但很少降到正常，伴有大量出汗。因肝内化脓、肝脏肿大膨胀，肝区常有持续性钝痛，查体可发现肝脏肿大，显著触痛。
以下因素对肝脓肿的愈后仍有预测作用：
1.脓肿的部位，细菌的种类和毒性。
2.多发性脓肿的死亡率高于单反性脓肿。
3.婴幼儿老年人等预后较差。
4.有并发症者预后差。