导致小肠出血主要是与血管发育不良、小肠肿瘤以及存在有炎症性的肠病所引起。
临床上出现小肠出血，有大部分患者是因为血管发育不良，出现了复合扩张，引起血管的黏膜变得比较薄弱，受到刺激就会引起血管出现破裂，而引起出血。如存在有炎症性的肠病，经常炎症刺激，尤其是小肠内出现溃疡，而引起出血，常见的也有放射性的小肠炎、动脉瘤等。
如果小肠内存在有平滑肌瘤和平滑肌肉瘤，也会出现小肠出血的症状，需要做小肠镜进行确诊，然后再对症处理。