病人大多可以自愈，但是排菌数月，病后最长排菌长达一年。给药物治疗，能迅速控制腹泻，终止排菌，可以选用阿米卡星、庆大霉素、阿莫西林等对症治疗。亦应重视有脱水者，一旦出现应予以纠正。
空肠弯曲菌在胆汁中增殖，然后侵犯空肠、回肠及结肠，肠粘膜病变明显，呈弥漫性出血水肿，渗出性病变，镜检下，肠固有层大量中性粒细胞、单核细胞浸润，小肠绒毛变性、萎缩。肠黏膜甚至可见溃疡及小脓肿。
除细菌分泌的毒素外，细菌外膜蛋白及鞭毛蛋白也是致病的主要因素，空肠弯曲菌除引起肠道病变外，尚引起肠道外病变。