食管异位组织主要表现出吞咽困难、恶心反胃，也可有吸入性呼吸困难等并发症。
食管与气管均由胚胎前肠发育而来，在胚胎第3周时两个为一共同管形器官，到第6周气管与食管分离过程中，食管壁内迷入气管软骨食管壁内会有黏液腺体，会发生在于食管下段。
少数患者会有中段狭窄，狭窄段与贲门间会看到一小囊袋状存钡区，这段为正常的，像钟摆，称为钟摆征，这个症状需要与贲门痉挛区别。食管内移位组织还可包括胰腺及甲状腺组织，但比较少见。