沙眼的根治，应从严谨的医学治疗和个人日常防护两个方面着手：
1.患有沙眼者，应尽早接受科学正规的治疗，将病情有效控制在一定范围内并消除，以防止眼睑瘢痕化、睑内翻、上睑下垂等并发症的出现。常规使用抗生素药物点眼，例如利福平、四环素、红霉素、氧氟沙星等，并使用生理盐水清洗结膜囊分泌物，防止炎症积存扩散。如果出现了后遗症，应及时采取手术干预。
2.日常生活中应注意个人卫生，尤其是眼部卫生，避免交叉感染和传播。