卡氏肺囊虫病是由卡氏肺囊虫感染引起的一种原虫病，多见于免疫功能低下或有免疫缺陷者，为机会性感染。对于该病治疗的常用药物，主要有以下几种：一、复方磺胺甲恶唑，是治疗该病的首选药物，首剂加倍，一般疗程为两周。如并发艾滋病者，疗程在三周左右。如治疗一周无效。可考虑换药。
二、喷他脒，主要用于复方磺胺甲恶唑治疗无效或对磺胺类药物过敏者。两周为一疗程，治疗期间密切监测肝肾功能、骨髓抑制情况、低血糖等副反应。三、其他药物如氨苯砜、乙胺嘧啶等。