婴儿心肌酶高的原因主要有下面几个原因：
1.缺氧而引起。当婴儿存在缺氧的症状也会影响到心肌细胞，导致身体分泌出较多的心肌酶，从而引起心肌酶增高的现象。
2.感染而引起。当婴儿存在细菌、病毒、支原体等致病菌的感染，也会导致心肌酶出现升高的现象。特别是婴儿之前出现反复的上呼吸道感染，或者胃肠道感染，都会导致心肌细胞受到影响而表现为心肌酶增高。
3.理化因素。主要是某些物理、化学因素导致，比如一氧化碳中毒、溶血等，可损伤心肌，引起心肌酶出现升高的反应。