盆底功能障障的危害是可以导致生殖和泌尿系统的疾病。
盆底组织保持一定的张力，对于盆腔器官的功能非常重要，盆底功能障碍可以导致盆底组织松弛，女性患者会表现为子宫脱垂，阴道可以出现前后壁的膨出，从而影响子宫和阴道的功能。盆底功能障碍，还可以导致女性出现尿失禁和排尿困难的表现。
盆底功能障碍对于男性也会产生影响，可以使男性的性功能下降，阴茎的勃起功能受到障碍等。盆底功能障碍，最终还会影响患者的心理，使患者心理压力增大。