临床上如果已经确诊是真菌性的尿路感染，在治疗方面主要通过口服抗真菌的药物进行杀灭致病菌，对因治疗同时结合临床症状配合服用三金片、碳酸氢钠片，可以缓解尿频、尿急的症状。
选择抗真菌的药物，临床可以使用的药物有很多，一般选择其中一种就可以的，比如氟康唑胶囊、制霉菌素胶囊、特比萘芬片、克霉唑胶囊、两性霉素B等。
由于这一类的药物副作用较大，容易对肝脏功能造成损伤，所以应该遵照医嘱按疗程用药，用药期间定期检查肝脏功能，了解肝脏功能有没有受损，一旦出现肝功能受损的情况，应当立即停药。