新生儿血尿不能盲目治疗，需要明确具体原因，然后对症处理。
因为新生儿血尿，分为假性血尿和真性血尿。假性血尿一般和尿酸增高，或者患有代谢性疾病，例如先天性紫癜有关。此时，应当积极治疗这些疾病，同时降低尿酸。如果是真性血尿，通常和泌尿系统感染或者泌尿系统肿瘤有关。
应当做泌尿系统超声检查，明确具体病因，例如由于泌尿系统感染导致，一般需要抗感染治疗，具体药物需要依据患儿自身情况进一步选择。如果是泌尿系肿瘤引起，应当通过手术方法将肿瘤切除治疗。