鼻窦炎明确诊断后首先应对症抗炎治疗，配合生理盐水及上颌窦穿刺冲洗治疗及雾化吸入治疗。
抗生素一般首选头孢类抗生素，头孢类抗生素对上呼吸道感染引起的鼻窦炎效果明显，配合多次上颌窦穿刺冲洗，能有效冲出鼻窦内脓性分泌物。
症状较轻病程较短的鼻窦炎患者一般三到四次上颌窦穿刺冲洗配合足量抗生素后，一般一周左右会逐渐痊愈；病程较长症状较顽固的鼻窦炎患者，上颌窦穿刺冲洗不能完全治愈鼻窦炎，可以通过手术彻底清除上颌窦内病损黏膜，开放上颌窦窦口，而达到根治鼻窦炎的目的。
术后可以应用激素类喷鼻剂减轻局部黏膜充血水肿症状，平时适度锻炼身体，避免感冒能有效降低鼻窦炎复发概率。