肺隐球菌病主要是由于新型隐球菌感染引起的，对于该病的预防主要措施如下：
一、由于长期大量应用抗生素以及糖皮质激素，可造成机体菌群失调、抑制免疫功能，为隐球菌的感染和扩散创造条件，因而应严格应用上述药物，杜绝滥用。对于长期应用上述药物的患者，若病情未见好转或恶化，应考虑有隐球菌感染的可能，及时行病原学检查。
二、隐球菌多继发于恶性肿瘤、慢性消耗性疾病和器官移植的患者，一旦发生可疑隐球菌感染，应立即查清病原及时治疗。
三、注意卫生，忌食腐烂变质的桃、梨等瓜果，防止鸽粪、鼠粪污染环境。